เรื่องราวของ Fallout 4 จะแตกต่างอย่างมากหากไม่มีลูกชายของ Sole Survivor และเนื่องจากความผิดพลาดที่อธิบายไม่ได้ สถานการณ์สมมตินี้จึงกลายเป็นจริงสำหรับผู้เล่นหนึ่งคน ภารกิจหลักใน Fallout 4 นั้นหมุนรอบการค้นหาตัวเอกของเรื่องสำหรับลูกที่หายไปของพวกเขา แม้ว่ากล่องทรายของเกมจะกระตุ้นให้ผู้เล่นหลีกทางไปตามทาง แต่การเผชิญหน้ากับ Shaun แบบตัวต่อตัวจะเป็นการเปิดเกมอย่างมีนัยยะสำคัญ สำหรับการเล่นส่วนใหญ่ การบุกเข้าไปในสถาบันถือเป็นจุดกึ่งกลางโดยธรรมชาติ เนื่องจากเป็นช่วงเวลาที่ผู้เล่นจะได้รู้จักกับกลุ่มหลักทั้งหมดในเครือจักรภพใน Fallout 4 โดยตรง ในหลายด้าน Shaun เป็นตัวแทนของตัวเอกคนที่สองของเรื่อง